FORGENOM SUMMER SCHOOL & HACKATHON 2025
Dňa 8. Júla 2025 sme odštartovali letnú školu FORGENOM II s pracovným názvom “Modern Bioinformatics towards Pangenomics”, v krásnom prostredí stredomorského ostrova Ischia v Taliansku. Letná škola potrvá od 8.7 do 12.7. Vyše 20 účastníkov, ktorými sú prevažne mladí výskumníci zo Slovenska, Talianska, ČR, Poľska, USA, UK, Japonska, si počas nasledujúcich 5 intenzívnych dní rozšíria svoje vedomosti a znalosti vo viacerých smeroch bioinformatiky, najmä v oblasti pangenomiky a moderných prístupoch v sekvenovaní a analýzy dát.
Od: Vedecký park UK
Konkrétne sa môžu tešiť na tieto zaujímavé témy:
- Introduction to Bioinformatics Services in Pangenomics and Cancer Genomics.
- Introduction to modern genome sequence technologies, data analysis and software tools in genome structural variations.
- Structural variations in diseases, mapping copy number variation by genome sequencing.
- Latest trend methods and experimental validation.
- Research challenges and entrepreneurship.
- How to disseminate results to the scientific biomedical community.
Tešíme sa vzácnych spíkrov
- Benedict Paten University of California, Santa Cruz, CA, US
- Erik Garrison University of Tennessee Health Science Center, Memphis, TN, US
- Mauricio Soto Gomez University of Milano, Milano, IT
- Tobias Rausch European Molecular Biology Laboratory (EMBL), Heidelberg, DE
- Tomáš Szemes Geneton s.r.o./ Comenius University in Bratislava, SK
- Vincenza Colonna University of Tennessee Health Science Center, Memphis, TN, US
To ale nie je všetko!
Po plne nabitej letnej škole ešte neodchádzajú. Čaká ich totiž FORGENOM HACKATHON!
Nesie názov From one genome to many a počas 3 dní, od 12.-14.7, zamestná účastníkov s praktickými cvičeniami na prácu s dátami v oblasti genomiky, proteomiky a bioinformatiky, konkrétne ich čaká:
- Analysis of Structural Variations.
- Free and Open software in Bioinformatics.
- Reproducibility of results.
Ďakujeme za prípravu praktických cvičení inštruktorom:
- Andrea Guarracino University of Tennessee Health Science Center, Memphis, TN, US
- Erik Garrison University of Tennessee Health Science Center, Memphis, TN, US
- Marcel Kucharík Geneton s.r.o./ Comenius Universivity in Bratislava, Slovakia
- Mauricio Soto Gomez University of Milano, Milano, IT
Ďakujeme partnerom projektu FORGENOM z Università di Milano – Bicocca: Simone Ciccolella, Gianluca Della Vedova, Paola Bonizzoni, za perfektnú prípravu obidvoch podujatí, tešíme sa na nadchádzajúce dni a na to, čo ste pre nás pripravili!
„S veľkým potešením vítame výskumníkov na tejto jedinečnej letnej škole a hackathone na Ischii. Naším cieľom je budovať dynamickú komunitu zameranú na modernú bioinformatiku a pangenomiku, podporovať spoluprácu naprieč disciplínami a poskytnúť účastníkom znalosti a nástroje potrebné na rozvoj genomického výskumu. Od objavovania najmodernejších sekvenačných technológií až po praktické hackathonové výzvy – toto podujatie podporí výmenu myšlienok a vytváranie nových riešení, ktoré môžu prospieť vede aj spoločnosti“ uviedol doc. Tomáš Szemes, hlavný koordinátor projektu FORGENOM II.